No futuro os mutantes e pessoas que podem gerar filhos mutantes são caçados e mortos impiedosamente por um exército de robôs chamados sentinelas, adaptados para copiar os poderes dos mutantes e usá los contra eles. Com isso os mutantes sobreviventes devem viver escondidos.

Um grupo formado pelo Professor Xavier, Magneto, Wolverine, Tempestade e Lince Negra procuram um meio de acabar com isso. Esse meio foi enviar Wolverine ao passado para encontrar os jovens Professor Xavier, Magneto, Mística e Fera para juntos impedirem esse futuro de trevas.